Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SnrpaQ62189 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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