Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbm38Q62176 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbm38Q62176 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbm38Q62176 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbm38Q62176 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbm38Q62176 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbm38Q62176 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbm38Q62176 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbm38Q62176 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbm38Q62176 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbm38Q62176 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbm38Q62176 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbm38Q62176 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Rbm38Q62176 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms