Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc2Q62029 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc2Q62029 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc2Q62029 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc2Q62029 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc2Q62029 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc2Q62029 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc2Q62029 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc2Q62029 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc2Q62029 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc2Q62029 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc2Q62029 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc2Q62029 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc2Q62029 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc2Q62029 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc2Q62029 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc2Q62029 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc2Q62029 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pabpc2Q62029 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc2Q62029 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms