Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd1Q61466 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms