Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcd2Q61285 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms