Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsg101Q61187 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsg101Q61187 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms