Protein–RNA interactions for Protein: Q61152

Ptpn18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn18Q61152 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ptpn18Q61152 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ptpn18Q61152 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ptpn18Q61152 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ptpn18Q61152 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ptpn18Q61152 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ptpn18Q61152 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ptpn18Q61152 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ptpn18Q61152 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ptpn18Q61152 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ptpn18Q61152 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn18Q61152 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms