Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cln3Q61124 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cln3Q61124 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cln3Q61124 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cln3Q61124 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cln3Q61124 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cln3Q61124 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cln3Q61124 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln3Q61124 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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