Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lamb3Q61087 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Lamb3Q61087 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms