Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rbbp4Q60972 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms