Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Slc6a4Q60857 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Slc6a4Q60857 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Slc6a4Q60857 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Slc6a4Q60857 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Slc6a4Q60857 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Slc6a4Q60857 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Slc6a4Q60857 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Slc6a4Q60857 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Slc6a4Q60857 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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