Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms