Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms