Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd5Q5VCS6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms