Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT6

Zkscan4, MCG23028, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan4Q5SZT6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zkscan4Q5SZT6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zkscan4Q5SZT6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zkscan4Q5SZT6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zkscan4Q5SZT6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zkscan4Q5SZT6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zkscan4Q5SZT6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zkscan4Q5SZT6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms