Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX79

Shroom1, Protein Shroom1, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom1Q5SX79 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shroom1Q5SX79 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms