Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms