Protein–RNA interactions for Protein: Q5BL07

Pex1, Peroxisome biogenesis factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex1Q5BL07 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pex1Q5BL07 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms