Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufaf2Q59J78 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms