Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E2f8Q58FA4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
E2f8Q58FA4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2f8Q58FA4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2f8Q58FA4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2f8Q58FA4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2f8Q58FA4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2f8Q58FA4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2f8Q58FA4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
E2f8Q58FA4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms