Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spire1Q52KF3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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