Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trp53i11Q4QQM4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Trp53i11Q4QQM4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Trp53i11Q4QQM4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trp53i11Q4QQM4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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