Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc3lQ4KL14 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms