Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc185Q3V118 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc185Q3V118 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc185Q3V118 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc185Q3V118 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc185Q3V118 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc185Q3V118 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc185Q3V118 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc185Q3V118 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc185Q3V118 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Ccdc185Q3V118 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc185Q3V118 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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