Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms