Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Lrrc43Q3V0L5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
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Lrrc43Q3V0L5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Lrrc43Q3V0L5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Lrrc43Q3V0L5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Lrrc43Q3V0L5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Lrrc43Q3V0L5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc43Q3V0L5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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