Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc114Q3UX62 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms