Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d1Q3UV55 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms