Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrc4Q3UP24 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms