Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms