Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b2Q3UJB0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms