Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx27Q3UHD6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx27Q3UHD6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms