Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms