Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip13Q3UA06 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms