Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Q3U6N9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Q3U6N9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q3U6N9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
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Q3U6N9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q3U6N9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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