Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ssbp4Q3U4B1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms