Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gse1Q3U3C9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gse1Q3U3C9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gse1Q3U3C9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gse1Q3U3C9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gse1Q3U3C9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms