Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc136Q3TVA9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc136Q3TVA9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc136Q3TVA9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc136Q3TVA9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms