Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms