Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Ctdnep1Q3TP92 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctdnep1Q3TP92 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms