Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43aQ3TL54 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim43aQ3TL54 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms