Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrx1Q3TL44 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms