Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca4Q3TKT4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 378.2 ms