Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdlim7Q3TJD7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms