Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trappc13Q3TIR1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms