Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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