Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.4 ms