Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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Shroom4Q1W617 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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Shroom4Q1W617 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shroom4Q1W617 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms