Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim71Q1PSW8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms