Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myo3bQ1EG27 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms